Nateraz je predčasné hovoriť o priebehu a závažnosti ochorenia, ktoré spôsobuje omikron variant nového koronavírusu. Informovalo o tom ministerstvo zdravotníctva s tým, že tento variant sa však šíri rekordne rýchlo.

Ministerstvo tvrdí, že zatiaľ nie je k dispozícii dostatok epidemiologických dát, na základe ktorých by bolo možné stanoviť, akú veľkú hrozbu tento nový variant predstavuje. Limitované dáta vypovedajú o tom, že omikron variant je oveľa infekčnejší.

Povinná karanténa

Úrad verejného zdravotníctva preto od stredy mení pravidlá pre osoby platné pri návrate z Juhoafrickej republiky a ďalších rizikových krajín. Platiť bude pre ne povinná karanténa.

Variant sa objavil po prvý raz v Juhoafrickej republike. Prvé importované prípady boli počas víkendu zaznamenané v Európskej únii, Veľkej Británii, Izraeli a Hongkongu.

V Českej republike potvrdili prvý prípad nákazy novým variantom v pondelok. Ide o osobu, ktorá sa vrátila z Afriky. Infikovaná žena je momentálne v izolácii. Výskyt koronavírusového variantu omikron oficiálne potvrdili aj v Rakúsku.

Hovorkyňa Úradu verejného zdravotníctva Daša Račková informovala o tom, že omikron variant, teda nový variant nového koronavírusu, sa na Slovensku v doposiaľ testovaných vzorkách nepotvrdil.

Nový variant omikron Mohol sa vyvinúť u HIV pacientov. O účinnosti vakcín rozhodnú nasledujúce týždne

Marek Holka

Variant zatiaľ nebol opísaný v žiadnych epidemiologických štúdiách. Ministerstvo preto hovorí, že zatiaľ sa nevie, ako sa bude reálne šíriť v svetovej populácii.

Presný rizikový profil omikron variantu bude možné podať až v priebehu niekoľkých týždňov, prípadne mesiacov, keď už budú verejne prístupné štúdie dokumentujúce štatisticky významnú skupinu pacientov.

Ministerstvo tiež uviedlo, že neexistujú dáta, na základe ktorých by sa dala určiť efektívnosť doterajších vakcín proti novému variantu. Neexistujú ani dáta, na základe ktorých by sa dalo určiť riziko ťažkého priebehu ochorenia, prípadne smrtnosť vírusu.

Publikované neboli ani žiadne štúdie, ktoré by určili inkubačnú dobu omikron variantu. Inkubačný čas zásadne ovplyvňuje, ako skoro je možné identifikovať nákazu v populácii.

Aký je omikron nebezpečný?

Nový variant covidu-19 s označením omikron B.1.1.529 získal v Juhoafrickej republike dominanciu za rekordných menej ako 20 dní. Dovtedy mala dominanciu delta.

Limitované dáta omikronu indikujú veľmi pravdepodobný potenciál extrémne vysokého R_0, čo by znamenalo vyššiu infekčnosť. Jednotlivé krajiny zavádzajú opatrenia s cieľom spomaliť jeho šírenie.

R₀ prvotného Wuhanského kmeňa bolo odhadované medzi 2 – 3, to znamená, že v priemere jedna infekčná osoba nakazila ďalšie dve až tri osoby.

R₀ „britského“ alfa variantu sa odhadovalo medzi 3,5 – 4,5 a vo väčšine štátov trvalo niekoľko mesiacov kým sa stal dominantným. R₀ „indického“ delta variantu sa odhaduje medzi 6 - 8. Zatiaľ nevieme s presnosťou určiť R₀ nového B.1.1.529 variantu.

Súčasné vakcíny nemusia byť proti omikronu účinné, tvrdí šéf Moderny

TASR

Vysoký počet mutácií na spike proteíne a rýchle šírenie potvrdzujú, že vakcíny by si mohli vyžadovať zmeny.

Na základe sekvenčných dát z Juhoafrickej republiky sa všaknazdávame, že je výrazne vyššie ako u predošlého delta variantu. Za menej ako 20 dní sa jeho podiel na sekvenovaných pozitívnych vzorkách zvýšil na viac ako 80%, čo vykazuje asi najrýchlejší rast aký kedy bol u SARS-CoV-2 variantov doposiaľ pozorovaný.

Efektívne reprodukčné číslo vyjadruje rýchlosť šírenia vírusu v danom časovom momente a mení sa na základe správania sa obyvateľstva, aktívnych kontrolných opatrení a zaočkovanosti populácie.

Efektívne reprodukčné číslo omikron variantu v JAR je odhadované na 2, kým u delta variantu na 1.48, čo ďalej potvrdzuje jeho evolučnú výhodu v rýchlom šírení.

To znamená, že i napriek protiepidemickým opatreniam a vysoko zaočkovanej populácií, jedna infikovaná osoba v priemere nakazí ďalšie dve osoby.

Kolektívna imunita až pri 90-percentnej zaočkovanosti

Na dosiahnutie kolektívnej imunity vo Wuhnaskom prostredí bolo potrebné zaočkovať iba 50 – 66 percent, v prostredí infekčnejšieho Alfa variantu sa zvýšila potreba zaočkovanosti populácie na 71 – 77 percent a v prostredí Delta variantu až na 83 – 88 percent.

Ak by R₀ nového variantu dosiahol hodnoty 10-12, tak by bolo nutné zaočkovať 90-92% populácie na to, aby sa efektívne zabránilo epidemickému rastu.

Pri narábaní s konceptom kolektívnej imunity však treba dôrazne podotknúť, že pri očkovaní nemôžeme nikdy ísť na samotnú matematicky vypočítanú hodnotu kolektívnej imunity. Vždy je potrebné ešte zaočkovať dodatočné percento a vytvoriť tak dodatočnú rezervu, lebo populácia sa vždy mieša nehomogénne, informuje rezort zdravotníctva.

Zhodnotiť bude treba aj generačný čas vírusu je doba, počas  ktorej sa infikovaná osoba stáva infekčnou, čiže schopnou šíriť nákazu ďalej v populácii. Krátke generačné časy predstavujú významný problém, lebo vďaka nim sa nákaza dokáže šíriť rýchlo a reťazovito.

Toto bola evolučná výhoda aj pri Delta variante, pri ktorom sa osoba stala v priemere infekčnou už na 2 – 3 deň. Klasické testovanie a vyhľadávanie kontaktov preto v prostredí Delta variantu stratilo významný efekt.

Kým úzke kontakty stihli byť skontaktované, zväčša už boli nielen infekčné, ale stihli nakaziť aj ďalšie osoby, čím Delta variant získal výrazný náskok. Zatiaľ neboli publikované žiadne štúdie, ktoré by zisťovali generačný čas omikron variantu.